Головна
Cоціологія || Гуманітарні науки || Мистецтво та мистецтвознавство || Історія || Медицина || Науки про Землю || Політологія || Право || Психологія || Навчальний процес || Філософія || Езотерика || Екологія || Економіка || Мови та мовознавство
ГоловнаМедицина → біохімія людини
««   ЗМІСТ   »»

КЛАСИФІКАЦІЯ ФЕРМЕНТІВ

Відомо більше 2000 різних реакцій, що каталізуються ферментами. Міжнародним союзом по біохімії (International Union of Biochemisry, IUB) створена і рекомендована до повсюдного використання систематика ферментів, що дозволяє орієнтуватися в цій множині біохімічних з'єднань.

Всі ферменти включені в «Каталог ферментів» під своїм класифікаційним номером (КФ), що складається з чотирьох цифр. В рамках цієї класифікації ферменти поділені на шість класів.

Вони класифікуються не як індивідуальні речовини, а як каталізатори певних хімічних перетворень або груп хімічних перетворень. Ферменти, виділені з різних біологічних джерел і каталізують ідентичні реакції, можуть досить істотно відрізнятися за своєю первинну структуру, проте всі вони в класифікації мають однаковий шифр.

Перша цифра шифру вказує на приналежність до одного з шести головних класів. Наступні дві визначають підклас і подподкласса, а остання - номер ферменту в даному подподкласса. наприклад, лактатдегидрогеназа має номер КФ 1.1.1.27 (клас 1 - оксидоредуктаз; підклас 1.1 - донор електрона (група - СН-ОН); подподкласса 1.1.1 (акцептор - NAD *).

В даний час прийняті два типи назв ферментів: робоче, або тривіальне, і систематичне. Робоча є назва субстрату, типу каталізуються реакції і закінчення -аза.

наприклад:

Лактат + дегідрогенізація (процес відщеплення Нч) + - аза = лактатдегидрогеназа.

Залишені робочі (тривіальні) назви для ряду давно відомих ферментів: пепсин, трипсин, хімотрипсин і т.д.

Систематичне назва ферменту утворюється складніше. Воно складається з назв субстратів хімічної реакції, на які діє фермент, назви типу катализируемого хімічного перетворення і закінчення -аза.

Наприклад, систематичне назва ферменту лактатдегідрогенази пишеться так:

Як сказано вище, все ферменти розділені на шість класів, в кожному з яких об'єднані ферменти, що володіють однаковою реакційної специфічністю.

До 1-го класу оксидоредуктаз відносяться практично всі ферменти, що каталізують окислювально-відновні перетворення.

Оксидоредуктази поділяються на 17 підкласів. Субстрат, що піддається окисленню Оксидоредуктази, розглядається як донор водню. Тому ферменти цього класу називають дегідрогеназ або, рідше, редуктази. Їх систематичне назва складається з назви відновника (донора електронів), окислювача (акцептора електронів) і назви класу.

Наприклад, фермент, що каталізує окислення етанолу до ацетальдегіду з використанням NAD * в якості окислювача, за систематичною номенклатурою називається алкоголь: NAD+ - оксидоредуктаза (шифр 1.1.1):

Підкласи оксидоредуктаз здебільшого визначаються типами з'єднань, які виступають в якості донорів електронів.

Ферменти, що каталізують окислення:

і діючі:

В окремі підкласи виділені ферменти (оксигенази), каталізують реакції введення в окислюються речовина одного атома кисню - підклас 14 (монооксигенази) або двох атомів кисню - підклас 13 (діоксигенази).

До 2-го класу трансферти відносять ферменти, які каталізують реакції перенесення різних груп від одного субстрату (донор) до іншого (акцептор), які не є гідролізом. Грансферази поділяються на 8 підкласів залежно від будови їх переносите ними груп. Ферменти, що каталізують перенесення метильних груп, називають метілтрансферазамн, амінних - амінотрансфе- разами і т. Д. В принципі, до трансферазу можна віднести і оксидоредуктаз, якщо вважати головним не процес окислення-відновлення, а перенесення групи від донора до акцептора, що супроводжується окісленіем- відновленням. Ці ферменти можна назвати протонтрансферазамі, електронтрансферазамі і т. Д.

Ферменти, що каталізують реакції перенесення:

ацетил-КоА (в латинському написанні СоА), що містить групу, що підлягає перенесенню, наприклад:

Ферменти 3-го класу - гідролізу - каталізують різні реакції гідролізу. Гідролази поділяються на 11 підкласів. Тривіальне їх назва утворюється шляхом приєднання до назви субстрату закінчення -аза. Систематичне назва обов'язково містить термін «гідролаза». В принципі, вони також можуть бути віднесені до трансферазу, оскільки гідроліз можна розглядати як перенесення специфічної групи субстрату, що є донором, на молекулу води, яка є акцептором. Однак роль води як акцептора вважається головною в дію цих ферментів, тому дані ферменти виділені в окремий клас гидролаз.

наприклад:

Підкласи виділяють відповідно до типу гідролізуемих зв'язків. Ферменти, що каталізують гідроліз:

Наприклад, каталізатор форміл-КоА-гідролаза (шифр 3.1.2):

Функцією більшого числа гідролаз є гідроліз біополімерів - білків, нуклеїнових кислот, полісахаридів. В основному це травні ферменти, наприклад пепсин - протеаза, що розщеплює білки на великі фрагменти.

Ферменти 4-го класу, ліази, в одному напрямку каталізують негідролітічним розщеплення субстрату з утворенням кратного зв'язку, а в іншому - приєднання кратного зв'язку.

наприклад:

При розриві зв'язку С-О виникає друга кратна зв'язок і утворюється молекула СО2 (фермент карбоан гід рази, шифр 4.2.1):

Ліази поділяються на чотири підкласу і класифікуються за типом розривається зв'язку:

Систематичне назва складається за принципом субстрат-група-ЛіАЗ. У тривіальних назвах ЛіАЗ вказується особливість участі груп в реакціях - карбоксилаза (приєднання карбоксильної групи), дегідратази (відібрання молекули води від субстрату).

Якщо необхідно підкреслити освіту субстрату з двох субстратів більш простого будови, то в назві ЛіАЗ вживається термін «синтаза», наприклад цитрат інтаза.

До 5-го класу відносять ізомерази - ферменти, що каталізують перетворення в межах однієї молекули, іншими словами, що каталізують різні процеси ізомеризації.

Ізомерази поділяються на п'ять підкласів. Назви ферментів складаються в залежності від типу реакції ізомеризації: мутази, таутомерази, раце- МАЗи. епімерази, ізомерази.

До підкласу 1 відносяться різні ферменти, за допомогою яких здійснюється звернення конфігурації при асиметричному атомі С:

(Каталізатором є 0-рибулозо-5-фосфат-3-епімерази, шифр 5.1.3);

до підкласу 2 - ферменти, що каталізують цис-транс-ізомеризації;

до підкласу 3 - каталізують внутрішньо-молекулярні процеси окислення- відновлення (взаємоперетворенням апьдегоз і кетоз);

до підкласу 4 - каталізують внутрішньомолекулярне перенесення різних фрагментів і т. д.

У 6-й клас об'єднані лігази (Синтетази), що каталізують реакції конденсації або приєднання, пов'язані з гідролізом і використанням енергії фосфатного зв'язку.

Джерелом енергії в реакціях, що каталізуються синтетазами, є АТР (АТФ) або інші нуклеозидтрифосфат.

наприклад:

Поділ лигаз на підкласи пов'язано з типом утвореною зв'язку. Це ферменти, що каталізують утворення зв'язків

Наприклад, в реакції

каталізатор - ацил-КоА-синтетаза (6.2.1).

  1. Когнітивні здібності в період дорослості - вікова фізіологія і психофізіологія
    На самих ранніх етапах зрілості відзначаються оптимум (точки найвищого підйому) зорової, слуховий, кінестетичний чутливості, які досягають максимального розвитку до 19-25 років. Потім їх розвиток стабілізується і зберігається приблизно на одному рівні до 40-річного віку. В цілому відбувається
  2. Кодування сигналів в слуховий сенсорної системі - вікова анатомія і фізіологія
    Розрізнення висоти звуку пов'язане з особливостями коливань основний мембрани в різних частинах равлики. Ця різниця пояснюється тим, що основна мембрана в міру віддалення від овального вікна і наближення до гелікотреми ширшає і її пластичність зростає. Завдяки цьому мембрана діє як аналізатор
  3. Клітинний склад (цитоархітектоніка) кори - вікова анатомія і фізіологія
    У корі великих півкуль налічується близько 14 млрд нейронів. Клітини і волокна в ній утворюють шість шарів (рис. 4.44). У самому поверхневому шарі клітини дрібні, нечисленні. Другий шар утворений нечисленними нейронами пирамидной форми невеликих розмірів. Розміри пірамідних нейронів збільшуються
  4. Клітинні механізми забезпечення спадковості і мінливості у людини - біологія. Частина 1
    У генетичному матеріалі людини в ряді ситуацій виникають зміни, які, безпосередньо не зачіпаючи окремих генів, викликають серйозні порушення в стані організму. Такі зміни найчастіше стосуються структури хромосом або їх числа в клітинах. Результатом цього є порушення балансу генів, т. Е. Того
  5. Клітини-мішені, рецептори - біохімія
    Фактично всі клітини тваринного організму є мішенями для тих чи інших гормонів. Справжня клітина-мішень - ця така клітина, в якій при гормональному впливі стимулюється специфічна біохімічна реакція клітинного метаболізму. Реалізація ефекту залежить від концентрації гормону, що взаємодіє з
  6. Клінічна холелитіаза - сестринська справа в хірургії
    У багатьох хворих з жовчними каменями симптоми захворювання можуть бути відсутні, якщо камені тільки почали формуватися або вже утворилися, але відрізняються невеликими розмірами і знаходяться в стані спокою. Ця фаза недуги називається латентною. Жовчні камені можуть бути виявлені при обстеженні
  7. Класифікація вітамінів - фізіологія харчування
    На підставі властивостей вітамінів і характеру їх поширення в природних продуктах, а також в залежності від розчинності в воді і жирі вітаміни класифікують наступним чином (табл. 4.1). Таблиця 4.1 Класифікація вітамінів і вітаміноподібна речовин Більшість вітамінів мають виражений неспецифічний
  8. Класифікація кислотно-основних буферних систем - біохімія людини
    Буферні системи можуть бути чотирьох типів. 1. Слабка кислота і її аніон А / НА. Наприклад, ацетатна буферна система СНзСОО / СН 3 СООН в розчині СНзСООИа і СН3СООН, область дії - інтервал pH 3,8-5,8; водень-карбонатна система НСО * / Н 2 СО 3 в розчині ИаНСОз і Н2СО3, область дії - pH 5,4-7,4
© 2014-2021  ibib.ltd.ua