В результаті утворення комплексу відбувається обмін електронами і протонами між ферментом і субстратом. Якщо фермент віддає електронну пару субстрату, т. Е. Якщо фермент є донором електронів, що здійснює нуклеофільних атаку, яка визначає швидкість ферментативної реакції, то має місце нуклеофільний каталіз. Швидкість каталітичної реакції визначається електронодонорної здатністю нуклеофіла, т. Е. Тих амінокислотних залишків активного центру, які взаємодіють з субстратом. Відносні швидкості нуклеофільної атаки залежать від енергії, необхідної для доставки електронної пари до атому субстрату. У електрофільне каталізі, навпаки, фермент акцептує пару електронів від субстрату. Електрофільні каталіз характерний для багатьох ферментів, що мають в своєму складі атоми металів. Метали зі змінною валентністю є електрофільними каталізаторами, які беруть електронну пару.
В процесі загального кислотно-основного каталізу відбувається перенесення протона або в межах молекули субстрату, або від одного субстрату до іншого. Слід зазначити, що багато електро- або нуклеофільниє реакції протікають більш ефективно, якщо вони супроводжуються одночасним перенесенням протона на субстрат. Для загального кислотно-основного каталізу характерна залежність швидкостей реакцій від будь-яких кислот або підстав, які перебувають в реакційній середовищі, на відміну від специфічного кіоютно-основного каталізу, який залежить тільки від протондонорних або протонакцепторних властивостей каталізатора.
Узагальнюючи уявлення про ферментативном каталіз, можна виділити наступні основні моменти.
Комплементарне приєднання субстрату до активного центру ферменту є основним фактором ефективного каталітичного процесу.
Комплементарність досягається за рахунок зміни конформації активного центру ферменту під дією субстрату, а також переведення субстрату в перехідний стан, индуцируемого функціональними угрупованнями активного центру ферменту.
Ефективний активний центр формується в кілька етапів. У найпростішому варіанті це пов'язано з утворенням третинної структури білка-ферменту, а також досягненням індукованої відповідності певним субстрату. У разі утворення ферментів в неактивному стані їх активація (наприклад, за рахунок обмеженого протеолізу) призводить до зміни конформації, що забезпечує взаємодію функціональних угруповань активного центру. Формування активних центрів складних ферментів обумовлено також приєднанням небелкового компонента.
Освіта фсрмснт-субстратного комплексу досягається за рахунок множинних контактів між ферментом і субстратом, причому чим більше цих контактів, тим ефективніше протікає каталітичний процес.
-Ферментативний каталіз в основному пов'язаний з обміном електронів і протонів між ферментом і субстратом або ж в межах молекули субстрату.
Транспозони - біохімія частина 2. Вивчення структур геномів різних організмів спочатку створило уявлення про непорушність локалізації тих чи інших генів в хромосомах. Це уявлення було переглянуто після відкриття Б. Мак Клінток, яка в дослідах з кукурудзою показала, що гени можуть переміщатися в межах геному і впливати на механізми
Транспорт ліпідів - біохімія частина 2. Транспорт ліпідів, ресинтезувати в епітеліальних клітинах кишечника. як і в інших тканинах, здійснюється в організмі за рахунок утворення ліпопротеїнових частинок, забезпечують транспорт ліпідів у водному середовищі і визначають його специфічну спрямованість (див. рис. 23.4). У клітинах епітелію
Транспорт амінокислот за допомогою у-глутамільного циклу - біохімія частина 2. Відповідно до гіпотези у-глутамільного циклу транспорту амінокислот через клітинні мембрани роль переносника амінокислот належить широко поширеній в біологічних системах трілептіду глутатіону: Нижче наведені реакції у-глутамільного циклу. I. Головну роль в цьому процесі відіграє мембрано-пов'язаний
Трансформація рослинних клітин - біохімія частина 2. Генетична трансформація рослинних клітин спостерігається в природних умовах. Освіта рослинних пухлин, наприклад корончастих галлів, індукується бактеріями Agrobacterium tumefacienc в результаті впровадження в клітку Ту-плазміди - кільцевої ДНК з молекулярною масою близько 1000 kDa. У плазмиде
Товстий кишечник - цитологія, гістологія і ембріологія Товстий кишечник включає в себе сліпу, ободову і пряму кишки. У товстому кишечнику відбуваються активні процеси бродіння трудноперевариваемой рослинної їжі за рахунок мікрофлори. Склад мікрофлори з віком тварини змінюється. У товстому кишечнику сік травних залоз, яких значно менше, складається
Типи з'єднання кісток - вікова фізіологія і психофізіологія Існують два основних типи з'єднання кісток: безперервний і переривчастий. безперервний тип характеризується повною нерухомістю. З'єднання цього типу утворюються за допомогою сполучної тканини (міжкісткові шви кісток черепа; зв'язки, що з'єднують відростки хребців; нижні кінці кісток гомілки
Типи клітинної організації - біологія. Частина 1 У природі існує значна різноманітність клітин, що розрізняються за розмірами, формою, хімічним особливостям. Число ж головних типів клітинної організації обмежена двома. Виділяють прокариотичний і еукаріотичний типи. Клітинам прокариотичного типу (Рис. 2.1, Л) властиві малі розміри (не більше